Membran sistemi, tasarım temeli olarak sürekli çalışmaya dayanır, ancak gerçek operasyonda, her zaman belirli bir başlatma ve kapatma sıklığı olacaktır.
Membran sistemi kapatıldığında, konsantre suyu yüksek konsantrasyonla değiştirmek için düşük basınçlı yıkama için geçirgen su veya önceden arıtılmış su kullanılmalıdır, ancak membran elemanından kireç inhibitörü içerir. Suyun sistemden sızmasını ve hava girmesini önlemek için de önlemler alınmalıdır, çünkü eleman su kaybederse ve kurursa geri dönüşümsüz bir geçirgen akı kaybı olabilir.
Duruş süresi 24 saatten azsa, mikrobiyal büyümeyi önlemek için herhangi bir önlem alınması gerekmez. Bununla birlikte, duruş süresi yukarıda belirtilen hükümleri aşarsa, sistemin korunması için koruyucu sıvı kullanılmalı veya membran sistemi düzenli olarak yıkanmalıdır.
